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Marnage
En fonction des déstockages d'eau, les niveaux d'eau d'un barrage hydroélectrique de type « lac » peuvent varier de plusieurs mètres au cours de l'année. Sur ces zones couramment noyées/dénoyées, le développement de la vie aquatique est très difficile. Ce phénomène est appelé le marnage.
Micropolluants organiques
Molécules chimiques de synthèse : hydrocarbures, dioxines, pesticides...